玉米粗缩病诱导下实时荧光定量PCR内参基因的选择

代资举1,#, 王艳1,#, 王新涛1, 杨青1, 张莹莹1, 李保全1, 王立平2,*
1河南省农业科学院作物设计中心, 郑州450002 2农业农村部食物与营养发展研究所, 北京100081

通信作者:王立平;E-mail: wangliping@caas.cn

摘 要:

为了选择玉米粗缩病诱导下合适的内参基因, 本研究选取ACT、 GADPH、 UBQ、 TUB、 CYP、 EF1A18S共7个基因做为候选内参基因, 以自交系郑58 (感粗缩病)和D863F (高抗粗缩病)为材料, 利用RT-qPCR技术检测这7个基因的表达情况。通过geNorm、 NormFinder和BestKeeper软件对循环阈值(Ct)进行数据分析。结果表明, 两材料在玉米粗缩病诱导下UBQEF1A基因表达最为稳定, ACT和18S最不稳定。另外, 选择玉米粗缩病相关基因ZmNPR1对候选内参基因进行进一步验证, 发现不合适的内参基因确实影响结果的准确性。 UBQEF1A两个最优内参基因的筛选为玉米粗缩病诱导下功能基因的表达分析及抗病机制的研究奠定基础。

关键词:玉米; 实时定量PCR; 内参基因; 玉米粗缩病

资助:农业部农产品质量安全监管专项(21301091702101)和河南省农业科学院科研发展专项(YCY20188102)。

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